MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020249	ATCA	2	8	53	60	50 %	25 %	0 %	25 %	449086466
2	NC_020249	ACC	2	6	112	117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086466
3	NC_020249	ATG	2	6	123	128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086466
4	NC_020249	TAC	2	6	218	223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086466
5	NC_020249	AAT	2	6	256	261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086466
6	NC_020249	TCC	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449086466
7	NC_020249	TCA	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086466
8	NC_020249	ATA	2	6	304	309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086466
9	NC_020249	TAA	2	6	401	406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086466
10	NC_020249	GCT	3	9	430	438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449086466
11	NC_020249	TTG	2	6	504	509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086466
12	NC_020249	TGT	2	6	544	549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086466
13	NC_020249	TTA	2	6	550	555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086466
14	NC_020249	TCA	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086466
15	NC_020249	CCT	2	6	590	595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449086466
16	NC_020249	GAAT	2	8	628	635	50 %	25 %	25 %	0 %	449086466
17	NC_020249	ATT	2	6	705	710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086466
18	NC_020249	TGT	2	6	739	744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086466
19	NC_020249	TTTTAA	2	12	753	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086466
20	NC_020249	TGT	2	6	777	782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086466
21	NC_020249	TTG	2	6	786	791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086466
22	NC_020249	TTC	2	6	799	804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086466
23	NC_020249	TA	3	6	810	815	50 %	50 %	0 %	0 %	449086467
24	NC_020249	T	6	6	892	897	0 %	100 %	0 %	0 %	449086467
25	NC_020249	TTC	2	6	904	909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086467
26	NC_020249	TGT	2	6	941	946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086467
27	NC_020249	AT	3	6	973	978	50 %	50 %	0 %	0 %	449086467
28	NC_020249	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086467
29	NC_020249	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086467
30	NC_020249	ACC	2	6	1471	1476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086467
31	NC_020249	CTTT	2	8	1628	1635	0 %	75 %	0 %	25 %	449086467
32	NC_020249	TCA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086467
33	NC_020249	GTA	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086467
34	NC_020249	ATA	2	6	1876	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086467
35	NC_020249	T	6	6	1904	1909	0 %	100 %	0 %	0 %	449086467
36	NC_020249	TTTA	2	8	1987	1994	25 %	75 %	0 %	0 %	449086467
37	NC_020249	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	449086467
38	NC_020249	ATAC	2	8	2086	2093	50 %	25 %	0 %	25 %	449086467
39	NC_020249	AT	3	6	2698	2703	50 %	50 %	0 %	0 %	449086468
40	NC_020249	TGA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086468
41	NC_020249	ATGAAA	2	12	2740	2751	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	449086468
42	NC_020249	TTA	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086468
43	NC_020249	AAG	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086468
44	NC_020249	A	6	6	2880	2885	100 %	0 %	0 %	0 %	449086468
45	NC_020249	TCC	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449086469
46	NC_020249	TTCC	2	8	3556	3563	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
47	NC_020249	TC	3	6	3682	3687	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
48	NC_020249	TTC	2	6	3710	3715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
49	NC_020249	TTC	2	6	3794	3799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
50	NC_020249	CCT	2	6	3931	3936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449086469
51	NC_020249	GACA	2	8	3973	3980	50 %	0 %	25 %	25 %	449086469
52	NC_020249	CTT	2	6	3985	3990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
53	NC_020249	AAC	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086469
54	NC_020249	GTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	50 %	0 %	449086469
55	NC_020249	TTC	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
56	NC_020249	CAG	2	6	4077	4082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086469
57	NC_020249	ATT	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086469
58	NC_020249	CAT	2	6	4126	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086469
59	NC_020249	TTC	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
60	NC_020249	TC	3	6	4383	4388	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
61	NC_020249	T	6	6	4391	4396	0 %	100 %	0 %	0 %	449086469
62	NC_020249	CTA	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086469
63	NC_020249	TCTTAA	2	12	4489	4500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086469
64	NC_020249	ATG	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086469
65	NC_020249	ATG	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086469
66	NC_020249	GC	3	6	4639	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	449086469
67	NC_020249	T	6	6	4834	4839	0 %	100 %	0 %	0 %	449086469
68	NC_020249	TCA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086469
69	NC_020249	CCT	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449086469
70	NC_020249	CCCA	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	449086469
71	NC_020249	TCA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086469
72	NC_020249	TAT	2	6	5249	5254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086469
73	NC_020249	CTA	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086469
74	NC_020249	GTAGCT	2	12	5370	5381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086469
75	NC_020249	A	6	6	5395	5400	100 %	0 %	0 %	0 %	449086469
76	NC_020249	ACT	2	6	5537	5542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086469
77	NC_020249	CTAA	2	8	5550	5557	50 %	25 %	0 %	25 %	449086469
78	NC_020249	CCA	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086469
79	NC_020249	AAAG	2	8	5602	5609	75 %	0 %	25 %	0 %	449086469
80	NC_020249	ATTAT	2	10	5652	5661	40 %	60 %	0 %	0 %	449086469
81	NC_020249	TTA	2	6	5704	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086469
82	NC_020249	ACT	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086469
83	NC_020249	GTT	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086469
84	NC_020249	GAG	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449086469
85	NC_020249	GTT	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086469
86	NC_020249	ATT	2	6	5918	5923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086469
87	NC_020249	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
88	NC_020249	CAA	2	6	5995	6000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086469
89	NC_020249	GTT	2	6	6004	6009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086469
90	NC_020249	ATT	2	6	6084	6089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086469
91	NC_020249	AAT	3	9	6103	6111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086469
92	NC_020249	CTT	2	6	6180	6185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
93	NC_020249	GAGCC	2	10	6196	6205	20 %	0 %	40 %	40 %	449086469
94	NC_020249	TCT	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
95	NC_020249	TCT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
96	NC_020249	TC	3	6	6528	6533	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
97	NC_020249	ATTGA	2	10	6644	6653	40 %	40 %	20 %	0 %	449086469
98	NC_020249	TCTCT	2	10	6661	6670	0 %	60 %	0 %	40 %	449086469
99	NC_020249	TAG	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086469
100	NC_020249	CT	3	6	6701	6706	0 %	50 %	0 %	50 %	449086469
101	NC_020249	TTC	2	6	6779	6784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086469
102	NC_020249	TTAA	2	8	6795	6802	50 %	50 %	0 %	0 %	449086469
103	NC_020249	TTCT	2	8	6964	6971	0 %	75 %	0 %	25 %	449086469
104	NC_020249	TACTTC	2	12	6980	6991	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	449086469
105	NC_020249	CATT	2	8	7020	7027	25 %	50 %	0 %	25 %	449086469
106	NC_020249	T	7	7	7446	7452	0 %	100 %	0 %	0 %	449086470
107	NC_020249	CAGC	2	8	7602	7609	25 %	0 %	25 %	50 %	449086470
108	NC_020249	TTC	2	6	7617	7622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086470
109	NC_020249	ACT	2	6	7668	7673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086470
110	NC_020249	ATC	2	6	7792	7797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086470
111	NC_020249	GCA	2	6	7930	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086470
112	NC_020249	GAT	2	6	8104	8109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086470
113	NC_020249	CCA	3	9	8110	8118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086470
114	NC_020249	GGT	2	6	8172	8177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449086470
115	NC_020249	AT	3	6	8188	8193	50 %	50 %	0 %	0 %	449086470
116	NC_020249	ACGGTT	2	12	8217	8228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449086470
117	NC_020249	GT	3	6	8258	8263	0 %	50 %	50 %	0 %	449086470
118	NC_020249	TTTA	2	8	9109	9116	25 %	75 %	0 %	0 %	449086471
119	NC_020249	TA	3	6	9123	9128	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
120	NC_020249	T	7	7	9129	9135	0 %	100 %	0 %	0 %	449086471
121	NC_020249	ATAG	2	8	9164	9171	50 %	25 %	25 %	0 %	449086471
122	NC_020249	ACC	2	6	9217	9222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086471
123	NC_020249	ATA	2	6	9242	9247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086471
124	NC_020249	TTG	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086471
125	NC_020249	ATC	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086471
126	NC_020249	GAT	2	6	9352	9357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086471
127	NC_020249	AGT	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086471
128	NC_020249	AGA	3	9	9435	9443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086471
129	NC_020249	A	6	6	9451	9456	100 %	0 %	0 %	0 %	449086471
130	NC_020249	ACA	2	6	9470	9475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086471
131	NC_020249	A	6	6	9510	9515	100 %	0 %	0 %	0 %	449086471
132	NC_020249	AGA	2	6	9589	9594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086471
133	NC_020249	TAC	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086471
134	NC_020249	TAA	2	6	9606	9611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086471
135	NC_020249	CAA	2	6	9634	9639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086471
136	NC_020249	TTTA	2	8	9640	9647	25 %	75 %	0 %	0 %	449086471
137	NC_020249	AT	3	6	9689	9694	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
138	NC_020249	AT	3	6	9789	9794	50 %	50 %	0 %	0 %	449086471
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140	NC_020249	TAA	2	6	9894	9899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086471
141	NC_020249	TAA	2	6	9922	9927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086471
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163	NC_020249	AAG	2	6	10891	10896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086472
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167	NC_020249	AT	3	6	11052	11057	50 %	50 %	0 %	0 %	449086472
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263	NC_020249	CAAAT	2	10	16010	16019	60 %	20 %	0 %	20 %	449086476
264	NC_020249	AGAT	2	8	16034	16041	50 %	25 %	25 %	0 %	449086476
265	NC_020249	GATT	2	8	16119	16126	25 %	50 %	25 %	0 %	449086476
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